Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W5

Calcrl, Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcrlQ9R1W5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CalcrlQ9R1W5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CalcrlQ9R1W5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CalcrlQ9R1W5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.3 ms