Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt71Q9R0H5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt71Q9R0H5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt71Q9R0H5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt71Q9R0H5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt71Q9R0H5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt71Q9R0H5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt71Q9R0H5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt71Q9R0H5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt71Q9R0H5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt71Q9R0H5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt71Q9R0H5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt71Q9R0H5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt71Q9R0H5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt71Q9R0H5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt71Q9R0H5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt71Q9R0H5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms