Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphs1Q9QZS7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nphs1Q9QZS7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms