Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col4a3Q9QZS0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col4a3Q9QZS0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col4a3Q9QZS0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a3Q9QZS0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a3Q9QZS0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a3Q9QZS0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a3Q9QZS0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a3Q9QZS0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a3Q9QZS0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a3Q9QZS0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a3Q9QZS0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a3Q9QZS0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col4a3Q9QZS0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col4a3Q9QZS0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col4a3Q9QZS0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col4a3Q9QZS0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a3Q9QZS0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a3Q9QZS0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col4a3Q9QZS0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a3Q9QZS0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms