Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Six6Q9QZ28 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Six6Q9QZ28 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms