Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nphp1Q9QY53 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Nphp1Q9QY53 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms