Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nufip1Q9QXX8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nufip1Q9QXX8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms