Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad18Q9QXK2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad18Q9QXK2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms