Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm4Q9QXA5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm4Q9QXA5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lsm4Q9QXA5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms