Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUJ7

Acsl4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl4Q9QUJ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acsl4Q9QUJ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acsl4Q9QUJ7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Acsl4Q9QUJ7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsl4Q9QUJ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsl4Q9QUJ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsl4Q9QUJ7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsl4Q9QUJ7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsl4Q9QUJ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsl4Q9QUJ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsl4Q9QUJ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Acsl4Q9QUJ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Acsl4Q9QUJ7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl4Q9QUJ7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acsl4Q9QUJ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms