Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nkain4Q9JMG4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkain4Q9JMG4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkain4Q9JMG4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkain4Q9JMG4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkain4Q9JMG4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkain4Q9JMG4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkain4Q9JMG4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkain4Q9JMG4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms