Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cabp1Q9JLK7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cabp1Q9JLK7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cabp1Q9JLK7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cabp1Q9JLK7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cabp1Q9JLK7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Cabp1Q9JLK7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cabp1Q9JLK7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cabp1Q9JLK7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cabp1Q9JLK7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Cabp1Q9JLK7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cabp1Q9JLK7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Cabp1Q9JLK7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cabp1Q9JLK7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cabp1Q9JLK7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cabp1Q9JLK7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cabp1Q9JLK7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cabp1Q9JLK7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cabp1Q9JLK7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cabp1Q9JLK7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cabp1Q9JLK7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cabp1Q9JLK7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cabp1Q9JLK7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cabp1Q9JLK7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cabp1Q9JLK7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cabp1Q9JLK7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cabp1Q9JLK7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cabp1Q9JLK7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Cabp1Q9JLK7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Cabp1Q9JLK7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Cabp1Q9JLK7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cabp1Q9JLK7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cabp1Q9JLK7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cabp1Q9JLK7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cabp1Q9JLK7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cabp1Q9JLK7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cabp1Q9JLK7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cabp1Q9JLK7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cabp1Q9JLK7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cabp1Q9JLK7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cabp1Q9JLK7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cabp1Q9JLK7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Cabp1Q9JLK7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Cabp1Q9JLK7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cabp1Q9JLK7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cabp1Q9JLK7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cabp1Q9JLK7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cabp1Q9JLK7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cabp1Q9JLK7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cabp1Q9JLK7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cabp1Q9JLK7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Cabp1Q9JLK7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cabp1Q9JLK7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cabp1Q9JLK7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cabp1Q9JLK7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cabp1Q9JLK7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cabp1Q9JLK7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cabp1Q9JLK7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms