Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtsmQ9JL96 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtsmQ9JL96 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms