Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hmgn5Q9JL35 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hmgn5Q9JL35 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmgn5Q9JL35 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hmgn5Q9JL35 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Hmgn5Q9JL35 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hmgn5Q9JL35 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms