Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacng4Q9JJV4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacng4Q9JJV4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacng4Q9JJV4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacng4Q9JJV4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacng4Q9JJV4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacng4Q9JJV4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacng4Q9JJV4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacng4Q9JJV4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacng4Q9JJV4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacng4Q9JJV4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacng4Q9JJV4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms