Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tssc4Q9JHE7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tssc4Q9JHE7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tssc4Q9JHE7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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