Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dap3Q9ER88 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dap3Q9ER88 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.7 ms