Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sil1Q9EPK6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Sil1Q9EPK6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Sil1Q9EPK6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sil1Q9EPK6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sil1Q9EPK6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sil1Q9EPK6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sil1Q9EPK6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sil1Q9EPK6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sil1Q9EPK6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sil1Q9EPK6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sil1Q9EPK6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sil1Q9EPK6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sil1Q9EPK6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sil1Q9EPK6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sil1Q9EPK6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms