Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBD2

March8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March8Q9DBD2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
March8Q9DBD2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
March8Q9DBD2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
March8Q9DBD2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
March8Q9DBD2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
March8Q9DBD2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
March8Q9DBD2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms