Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bpifa3Q9D9J8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bpifa3Q9D9J8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bpifa3Q9D9J8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bpifa3Q9D9J8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Bpifa3Q9D9J8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bpifa3Q9D9J8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Bpifa3Q9D9J8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bpifa3Q9D9J8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Bpifa3Q9D9J8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Bpifa3Q9D9J8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms