Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Alkbh4Q9D8F1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alkbh4Q9D8F1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh4Q9D8F1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms