Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fip1l1Q9D824 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fip1l1Q9D824 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms