Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S0

Lypd8, Ly6/PLAUR domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lypd8Q9D7S0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lypd8Q9D7S0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lypd8Q9D7S0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lypd8Q9D7S0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lypd8Q9D7S0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lypd8Q9D7S0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lypd8Q9D7S0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lypd8Q9D7S0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lypd8Q9D7S0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lypd8Q9D7S0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lypd8Q9D7S0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lypd8Q9D7S0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lypd8Q9D7S0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lypd8Q9D7S0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lypd8Q9D7S0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lypd8Q9D7S0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lypd8Q9D7S0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lypd8Q9D7S0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lypd8Q9D7S0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lypd8Q9D7S0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lypd8Q9D7S0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lypd8Q9D7S0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms