Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
2310002L09RikQ9D7L5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
2310002L09RikQ9D7L5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
2310002L09RikQ9D7L5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
2310002L09RikQ9D7L5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
2310002L09RikQ9D7L5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
2310002L09RikQ9D7L5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
2310002L09RikQ9D7L5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
2310002L09RikQ9D7L5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
2310002L09RikQ9D7L5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
2310002L09RikQ9D7L5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
2310002L09RikQ9D7L5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
2310002L09RikQ9D7L5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
2310002L09RikQ9D7L5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
2310002L09RikQ9D7L5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
2310002L09RikQ9D7L5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
2310002L09RikQ9D7L5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
2310002L09RikQ9D7L5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
2310002L09RikQ9D7L5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
2310002L09RikQ9D7L5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
2310002L09RikQ9D7L5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms