Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nsmce1Q9D720 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nsmce1Q9D720 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nsmce1Q9D720 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms