Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Necab3Q9D6J4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Necab3Q9D6J4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Necab3Q9D6J4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Necab3Q9D6J4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms