Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb4aQ9D6F9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb4aQ9D6F9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb4aQ9D6F9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms