Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt34Q9D646 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt34Q9D646 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Krt34Q9D646 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms