Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam227bQ9D518 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam227bQ9D518 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam227bQ9D518 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.7 ms