Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3404Q9D506 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3404Q9D506 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3404Q9D506 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3404Q9D506 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3404Q9D506 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3404Q9D506 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3404Q9D506 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3404Q9D506 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3404Q9D506 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3404Q9D506 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3404Q9D506 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3404Q9D506 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3404Q9D506 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3404Q9D506 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3404Q9D506 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3404Q9D506 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3404Q9D506 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3404Q9D506 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3404Q9D506 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3404Q9D506 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms