Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4931428L18RikQ9D4S9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms