Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933428M09RikQ9D3X3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933428M09RikQ9D3X3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms