Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Stag1Q9D3E6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Stag1Q9D3E6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Stag1Q9D3E6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Stag1Q9D3E6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Stag1Q9D3E6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Stag1Q9D3E6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stag1Q9D3E6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stag1Q9D3E6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stag1Q9D3E6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stag1Q9D3E6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stag1Q9D3E6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stag1Q9D3E6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stag1Q9D3E6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stag1Q9D3E6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Stag1Q9D3E6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Stag1Q9D3E6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stag1Q9D3E6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stag1Q9D3E6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stag1Q9D3E6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stag1Q9D3E6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stag1Q9D3E6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stag1Q9D3E6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stag1Q9D3E6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stag1Q9D3E6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stag1Q9D3E6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stag1Q9D3E6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stag1Q9D3E6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stag1Q9D3E6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stag1Q9D3E6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stag1Q9D3E6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stag1Q9D3E6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stag1Q9D3E6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stag1Q9D3E6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms