Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trmt44Q9D2Q2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trmt44Q9D2Q2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trmt44Q9D2Q2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trmt44Q9D2Q2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Trmt44Q9D2Q2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trmt44Q9D2Q2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trmt44Q9D2Q2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Trmt44Q9D2Q2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trmt44Q9D2Q2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trmt44Q9D2Q2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trmt44Q9D2Q2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trmt44Q9D2Q2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trmt44Q9D2Q2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trmt44Q9D2Q2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trmt44Q9D2Q2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trmt44Q9D2Q2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trmt44Q9D2Q2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trmt44Q9D2Q2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trmt44Q9D2Q2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trmt44Q9D2Q2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trmt44Q9D2Q2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trmt44Q9D2Q2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Trmt44Q9D2Q2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trmt44Q9D2Q2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trmt44Q9D2Q2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trmt44Q9D2Q2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms