Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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Hddc3Q9D114 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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Hddc3Q9D114 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
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Hddc3Q9D114 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
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Hddc3Q9D114 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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Hddc3Q9D114 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hddc3Q9D114 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hddc3Q9D114 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hddc3Q9D114 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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Hddc3Q9D114 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hddc3Q9D114 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hddc3Q9D114 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hddc3Q9D114 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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Hddc3Q9D114 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hddc3Q9D114 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hddc3Q9D114 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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Hddc3Q9D114 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hddc3Q9D114 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hddc3Q9D114 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hddc3Q9D114 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hddc3Q9D114 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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Hddc3Q9D114 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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Hddc3Q9D114 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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Hddc3Q9D114 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hddc3Q9D114 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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