Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Polr3eQ9CZT4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Polr3eQ9CZT4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Polr3eQ9CZT4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr3eQ9CZT4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr3eQ9CZT4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr3eQ9CZT4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr3eQ9CZT4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr3eQ9CZT4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr3eQ9CZT4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr3eQ9CZT4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr3eQ9CZT4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr3eQ9CZT4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr3eQ9CZT4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr3eQ9CZT4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr3eQ9CZT4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr3eQ9CZT4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr3eQ9CZT4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr3eQ9CZT4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr3eQ9CZT4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr3eQ9CZT4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Polr3eQ9CZT4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr3eQ9CZT4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms