Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR4

Cmtm8, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm8Q9CZR4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmtm8Q9CZR4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmtm8Q9CZR4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm8Q9CZR4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms