Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins3Q9CY94 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gins3Q9CY94 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms