Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY3

Setd6, N-lysine methyltransferase SETD6, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd6Q9CWY3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setd6Q9CWY3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd6Q9CWY3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd6Q9CWY3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Setd6Q9CWY3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd6Q9CWY3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd6Q9CWY3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd6Q9CWY3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd6Q9CWY3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms