Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1aQ9CU62 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc1aQ9CU62 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms