Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms