Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rprd1bQ9CSU0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rprd1bQ9CSU0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms