Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Msmo1Q9CRA4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msmo1Q9CRA4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msmo1Q9CRA4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msmo1Q9CRA4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msmo1Q9CRA4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msmo1Q9CRA4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msmo1Q9CRA4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msmo1Q9CRA4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msmo1Q9CRA4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msmo1Q9CRA4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Msmo1Q9CRA4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msmo1Q9CRA4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msmo1Q9CRA4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msmo1Q9CRA4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msmo1Q9CRA4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msmo1Q9CRA4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msmo1Q9CRA4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msmo1Q9CRA4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msmo1Q9CRA4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms