Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadd45gip1Q9CR59 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gadd45gip1Q9CR59 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gadd45gip1Q9CR59 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms