Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc43Q9CR29 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc43Q9CR29 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc43Q9CR29 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc43Q9CR29 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms