Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pop4Q9CR08 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pop4Q9CR08 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms