Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg12Q9CQY1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg12Q9CQY1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms