Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX5

Cldnd1, Claudin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd1Q9CQX5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldnd1Q9CQX5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldnd1Q9CQX5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldnd1Q9CQX5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldnd1Q9CQX5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldnd1Q9CQX5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldnd1Q9CQX5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldnd1Q9CQX5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldnd1Q9CQX5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldnd1Q9CQX5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldnd1Q9CQX5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldnd1Q9CQX5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldnd1Q9CQX5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldnd1Q9CQX5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cldnd1Q9CQX5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cldnd1Q9CQX5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldnd1Q9CQX5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldnd1Q9CQX5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldnd1Q9CQX5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldnd1Q9CQX5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldnd1Q9CQX5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldnd1Q9CQX5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldnd1Q9CQX5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldnd1Q9CQX5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldnd1Q9CQX5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms