Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pole4Q9CQ36 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Pole4Q9CQ36 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pole4Q9CQ36 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms