Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrc18Q9CQ07 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc18Q9CQ07 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc18Q9CQ07 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms